在 Windows Server 2003 SP2 正式发布以后，经过 ISA Server 开发组的测试，发现在以下三个方面存在兼容性问题：
1、如果运行的是 ISA Server 2004 企业版，那么你必须先在配置存储服务器上安装ADAM SP1，然后才能安装 Windows Server 2003 SP2，否则将会导致ISA Server 2004 无法正常启动。ADAM SP1的下载地址为：
2、在 Windows Server 2003 SP2 中引入了新的中断处理方式，但是在部分32位多处理器计算机上，如果CPU具有较高的利用率，那么可能会导致 ISA Server 的性能下降。如果出现这种问题，可以使用 Windows Server 2003 资源工具包中的中断关联工具进行修改。
中断关联工具（intfiltr.exe）下载地址为：
相关使用说明为：
http://support.microsoft.com/kb/252867
3、如果你的网络适配器支持接收端调节（Receive-side Scaling）功能，那么在特定场景下可能出现NAT不能正常工作的情况，相关信息请参见
Windows Server 2003 SP2 与 NAT 的兼容性问题
